V Naruto svete sú v Hidden Villages tisíce ninjov. Séria sa zameriava hlavne na nich, takže pre náhodnejších fanúšikov môže byť prekvapením, že dediny v skutočnosti nie sú všetko. Každá dedina je ako malý suverénny národ žijúci vo väčšej krajine, v ktorej vládne feudálny pán alebo Daimyo. Predtým, ako tieto dediny založil prvý Hokage, rozličné krajiny obhospodarovali určití feudáli, ktorí uzavreli kontrakty s rôznymi ninja klanmi, aby za ne bojovali a bojovali. Počas tejto doby deti zomreli mladé a z tých, čo prežili, vyrástli pomstychtiví dospelí.
Založenie skrytých dedín poskytlo štruktúru darebáckej spoločnosti, ktorá sa zúfalo snažila o jednotu a efektívnosť. Tieto dediny sa nakoniec zakorenili v každom národe a dostali sa do služieb svojho príslušného Daimja.
Krajiny fungujú ako samostatné politické subjekty, pričom skryté krajiny sú súčasťou pôdy, kde žijú ninja. Vedúci týchto dedín, Five Kage, stoja ako generáli, ktorí sa starajú o záležitosti shinobi. Tým, že Skryté dediny od mladého veku vzdelávajú svojich občanov, aby boli ninja, udržujú svoju ekonomiku tým, že ich využívajú ako pracovnú silu v rôznych misiách, za ktoré sú iní ochotní zaplatiť, od vytrhávania záhrady cez atentáty na politikov až po vojakov v prípade, že je krajina zapojená do vojna.
Krajina ohňa
V jednej z najväčších a najmocnejších krajín vládne Ohňovej zemi Fire Daimyo a ako prvá prijala Skrytú dedinu. Aj keď nie je fyzicky najväčšou krajinou, Konoha je najväčšou dedinou ninja a je domovom hlavných postáv série. Keď Hashirama Senju a Madara Uchiha založili Konohu, známu tiež ako „dedinu skrytú v listoch“, bolo to so zámerom zjednotiť nesúrodé klany krajiny a spojiť sa s feudálnym pánom.
Predtým boli ninja organizovaní do malých žoldnierskych klanov, ktoré si najal ten, kto im vzal zmluvu. V snahe ukončiť krviprelievanie uzavrel Hashirama s Madarou prímerie a založil Konohagakure, meno, ktoré sám vymyslel. Ostatné dediny čoskoro nasledovali ich príklad a vytvorili päť veľkých krajín Shinobi a čím sa v podstate končí éra bojujúcich štátov.
Krajina vetra
Nachádza sa na juhozápad od Ohňovej krajiny a hraničí s riekou (a Amegakure, dedinou skrytých dažďov). Krajina vetra je riadená vetrom Daimyo, krajinou pokrývajúcou rozsiahlu oblasť púšte s nízkou produktivitou. Kvôli malým dažďom je dedina skrytá v piesku alebo Sunagakure postavená na jednej z najväčších oáz púšte. S veľkým počtom obyvateľov v tak drsnom prostredí bojovala krajina vetra s krajinou ohňa v minulosti o zdroje, ale čiastočne vďaka priateľstvu medzi Kagesom Narutom a Gaarom sú teraz v dobrom vzťahu a majú prospech z obchod medzi týmito dvoma krajinami.
Krajina vody
Táto krajina známa tiež ako „krajina hmly“ pozostáva z mnohých ostrovov, z ktorých každý má svoje vlastné jedinečné tradície a kultúry. Water Daimyo je vládnym vodcom týchto ostrovov, ktoré sú zvyčajne pokryté hmlou, počasie je zvyčajne chladné, ale v niektorých oblastiach dosť sneží. Skrytá hmlová dedina alebo Kirigakure, ktorá sa predtým niektorými označovala ako „dedina krvavej hmly“, má tajomnú a násilnú históriu. V rámci piateho Mizukage však Kiri zreformovala svoje vnútorné politiky a dnes je z nej moderné a prosperujúce mesto; ešte progresívnejšie ako Konoha a hlavný obchodný uzol pre medzinárodný tovar.
Krajina osvetlenia
Polostrov severovýchodne od Ohňovej krajiny vládne tejto hornatej krajine Osvetlenie Daimyo, ktorého názov dáva krajine veľa búrok. Niekde v týchto pohoriach je „Dedina skrytá v oblakoch“ aleboKumogakure. Kumo mal nestále vzťahy s Ohňovou zemou, pričom každý z nich bol na rôznych stranách rôznych bojov. Kvôli misii Kumo upevniť moc podnikli početné pokusy o ukradnutie kekkei genkai a jutsu z iných dedín, čo takmer viedlo k vojne. S érou piateho Raikage sú však všetky národy opäť v dobrom vzťahu a Kumo teraz pracuje v prospech všetkých dedín.
Zem Zeme
Severozápadne od Ohňovej krajiny sa nachádza Zem Zeme, jej vládnym vodcom je Zem Daimyo a zemou sú predovšetkým pusté skalnaté oblasti.Iwagakure alebo dedina skrytá v kameňoch má prírodnú pevnosť vyrobenú z okolitej skaly a kameňa. Iwa viedla počas svojej histórie rôzne vojny a konflikty s mnohými dedinami vrátane Suny, Kiri a Konoha. Aj v čase mieru sa Iwa sprisahala proti národom, s ktorými uzavrela zmluvy. Dokonca aj po skončení štvrtej veľkej nindžovskej vojny a po mieri, ktorý nasledoval, keď jej vodca nakoniec bol rozčarovaný z novonadobudnutej jednoty sveta.
Podobne ako v aspektoch feudálneho Japonska, aj zmluvy medzi národmi sa pravidelne podpisovali, ale nestáli oveľa viac ako práca, na ktorej boli napísané. Štvrtá veľká nindžská vojna však tieto krajiny zjednotila a začala éru mieru. Krajiny ohňa, vetra, vody, osvetlenia a Zeme môžu byť samostatnými národmi, ktorým vládne Daimyo, ale Skryté dediny týchto národov a ich hlavy majú rovnaké postavenie ako ich majitelia. Ako vojenské zložky týchto krajín nimi prerušujú alebo udržiavajú diplomatické vzťahy, ale ich hospodárstva sú udržiavané vzťahmi, ktoré udržiavajú s krajinami, v ktorých sídlia. Tento cyklus predstavuje ekonomickú krv pre šinobi a povedie túto adaptívnu spoločnosť budúcnosť.
